MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Leptospirillum ferrooxidans C2-3

Total Repeats: 6582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017094	CCTGA	2	10	2612	2621	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_017094	TGTT	2	8	5118	5125	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017094	ATTC	2	8	5130	5137	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017094	AAT	2	6	9908	9913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017094	GAG	2	6	11552	11557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017094	TGG	2	6	12069	12074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017094	T	6	6	12108	12113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017094	CCA	2	6	12117	12122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017094	TGAT	2	8	12149	12156	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017094	CTC	2	6	12222	12227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_017094	ATC	2	6	12232	12237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017094	ACA	2	6	12244	12249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017094	CAA	2	6	12257	12262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017094	TGC	2	6	12275	12280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017094	CCTG	2	8	12370	12377	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017094	GT	3	6	12419	12424	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017094	A	8	8	12449	12456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017094	TTC	2	6	12475	12480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017094	CGC	2	6	12512	12517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_017094	CCA	2	6	12520	12525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_017094	T	6	6	12588	12593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017094	TCT	2	6	12636	12641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017094	CT	3	6	12644	12649	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017094	CTT	2	6	12742	12747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017094	ATC	2	6	12771	12776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017094	TCCCCT	2	12	12790	12801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_017094	ATG	2	6	12840	12845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017094	GAAT	2	8	12889	12896	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017094	CCTT	2	8	15308	15315	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017094	CTT	2	6	15342	15347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017094	TTC	2	6	17231	17236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017094	TTAT	2	8	17279	17286	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017094	CT	3	6	17311	17316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017094	ACA	2	6	17332	17337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017094	TTC	2	6	17350	17355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017094	GATTG	2	10	17384	17393	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017094	AGG	2	6	17785	17790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017094	TTA	2	6	18814	18819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017094	CAT	2	6	18833	18838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017094	TTA	2	6	18849	18854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017094	T	6	6	18874	18879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017094	AC	3	6	18887	18892	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017094	CTA	2	6	18911	18916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017094	TTCT	2	8	20177	20184	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017094	TCT	2	6	20833	20838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017094	TTC	2	6	20896	20901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017094	TGG	2	6	20920	20925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017094	CAA	2	6	20986	20991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017094	AAAAC	2	10	20993	21002	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017094	CAT	2	6	21027	21032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017094	TAAA	2	8	21043	21050	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017094	TGAG	2	8	21127	21134	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017094	ACC	2	6	21135	21140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_017094	GAG	2	6	21467	21472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017094	AATC	2	8	21473	21480	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017094	TC	3	6	21517	21522	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017094	CAA	2	6	21597	21602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017094	AGG	2	6	21606	21611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017094	CGA	2	6	21623	21628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017094	TTC	2	6	21669	21674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017094	T	6	6	21704	21709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017094	GAA	2	6	21988	21993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017094	CGC	3	9	22102	22110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017094	T	6	6	22169	22174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017094	GA	3	6	22199	22204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017094	ATCC	2	8	22205	22212	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017094	TGG	2	6	23829	23834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017094	AC	3	6	23859	23864	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017094	GAT	3	9	23886	23894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017094	CAT	2	6	23910	23915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017094	CAT	2	6	23925	23930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017094	CCAG	2	8	24410	24417	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017094	CAC	2	6	24488	24493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_017094	TCC	2	6	24525	24530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_017094	GAT	2	6	24550	24555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017094	TTTG	2	8	25676	25683	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017094	GATC	2	8	28737	28744	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017094	TGG	2	6	28790	28795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017094	CCT	2	6	28796	28801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_017094	GAC	2	6	28832	28837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017094	T	6	6	28943	28948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017094	ATCT	2	8	28988	28995	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017094	T	8	8	29024	29031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017094	T	7	7	29058	29064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017094	TGTA	2	8	29116	29123	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017094	ATT	2	6	29160	29165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017094	CT	3	6	29189	29194	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017094	CAT	2	6	29281	29286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017094	GATT	2	8	29328	29335	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017094	TGA	2	6	32854	32859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017094	GGGAA	2	10	32911	32920	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017094	CATAT	2	10	32996	33005	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017094	TGG	2	6	36756	36761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017094	TGG	2	6	36850	36855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017094	A	6	6	36901	36906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017094	A	6	6	38857	38862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017094	GAG	3	9	38906	38914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017094	AAG	2	6	39595	39600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017094	GGGA	2	8	39603	39610	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017094	C	7	7	39616	39622	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
101	NC_017094	GGA	2	6	45540	45545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017094	T	7	7	47166	47172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017094	TCCA	2	8	47299	47306	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017094	TCTTGT	2	12	47345	47356	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_017094	GTG	2	6	47370	47375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017094	TTC	2	6	47495	47500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017094	ATC	2	6	47549	47554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017094	T	6	6	52128	52133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017094	A	6	6	52161	52166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017094	AGAA	2	8	52174	52181	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017094	TTG	2	6	52211	52216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017094	TGT	2	6	54039	54044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017094	GGGT	2	8	54056	54063	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017094	TCC	2	6	54537	54542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_017094	TCA	2	6	54559	54564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017094	TTCC	2	8	54584	54591	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017094	TCC	2	6	54616	54621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_017094	A	6	6	54636	54641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017094	GATT	2	8	54645	54652	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017094	ACA	2	6	54676	54681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017094	GTATC	2	10	55545	55554	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017094	TCT	2	6	55578	55583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017094	TTTG	2	8	55584	55591	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017094	T	6	6	55648	55653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017094	ATC	2	6	55662	55667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017094	T	7	7	55849	55855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017094	A	6	6	55857	55862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017094	CCG	2	6	55916	55921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_017094	CAT	2	6	55935	55940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017094	T	7	7	55998	56004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017094	CCCA	2	8	56012	56019	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
132	NC_017094	CCA	2	6	58508	58513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_017094	AAT	2	6	58531	58536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017094	TCT	2	6	61186	61191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017094	G	6	6	61222	61227	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017094	AGCT	2	8	61243	61250	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017094	GATG	2	8	66064	66071	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017094	GA	3	6	66072	66077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017094	AG	3	6	66091	66096	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017094	GAT	2	6	66244	66249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017094	TCCGTT	2	12	66260	66271	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017094	TTC	2	6	66338	66343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017094	TCC	2	6	66349	66354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_017094	AG	3	6	66479	66484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017094	GAAGG	2	10	66500	66509	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017094	AGA	2	6	66539	66544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017094	CT	3	6	66586	66591	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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183	NC_017094	T	7	7	77451	77457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_017094	AAG	2	6	78173	78178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_017094	TCT	2	6	78249	78254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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287	NC_017094	TTC	2	6	105485	105490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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433	NC_017094	T	8	8	170412	170419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_017094	GTC	2	6	170449	170454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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442	NC_017094	CGG	2	6	171284	171289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
443	NC_017094	TTCCC	2	10	171318	171327	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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447	NC_017094	T	6	6	173943	173948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_017094	T	6	6	174303	174308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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455	NC_017094	GAA	2	6	184949	184954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
456	NC_017094	T	8	8	184971	184978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
457	NC_017094	GAT	2	6	185716	185721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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464	NC_017094	ATT	2	6	194229	194234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_017094	TGT	2	6	194247	194252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
466	NC_017094	T	6	6	194252	194257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
467	NC_017094	A	7	7	194259	194265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
468	NC_017094	ATC	2	6	194276	194281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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470	NC_017094	T	6	6	194311	194316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_017094	A	7	7	194366	194372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_017094	T	6	6	194390	194395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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